“金税工程”运用了一个管帐知识，即出售方开具的4联发票，尤其是抵扣联和存根联所登录的数据有必要相同，不然增值税进项税额不予抵扣。到2002年“金税”工程建造完成后，税务机关能够对每年的约3亿份增值税专用发票和120万户增值税一般交税人的交税申报材料施行即时的监控，对一切的增值税专用发票和一般交税人的运营行为、交税行为，能够随时把握、剖析、监督，全国的增值税一般交税人的状况和其所运用的增值税专用发票的信息都进入了规范性的程序之中。开假发票、开“大头小尾”阴阳票等偷逃国家税款的行为将无处遁形。“金税工程”的防伪税控体系正是从这些方面堵住了税款丢失的缝隙。

　　一起，“金税工程”能够和进步企业信誉等级以及商誉挂钩。当购货方对供货方信誉有疑问时，可先使进项发票经过认证和穿插稽核之后再付款，这样销货企业为及时回收金钱，就回不断进步自己的信誉度，然后促进一切企业的信誉水平遍及进步。

　　“金税工程”施行以来，已有越来越多的增值税一般交税人自动要求运用防伪税控开票子体系，阐明这套体系再实践运用中对进步企业商誉的作用是显着的。

　　“金税工程”的另一个重要作用，是能够有效地防备和遏止糜烂行为。因为“金税工程”的另一个重要作用，是以国家税务总局、省级国税局、地市国税局、县级国税局4级网络为依托，上级税务机关贯彻落实税收政策依法纳税的行为进行监督和限制，下一级税务机关的各项法律行为均纳入了上级税务机关的监控，然后确保了税务人员法律的透明性和公证性，有利于税收队伍建造和避免糜烂现象的发生。